MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 58724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	TTC	2	6	1190	1195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
2	NC_016023	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750443
3	NC_016023	T	7	7	1363	1369	0 %	100 %	0 %	0 %	347750443
4	NC_016023	TCATTT	2	12	1381	1392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347750443
5	NC_016023	TCGTC	2	10	1525	1534	0 %	40 %	20 %	40 %	347750443
6	NC_016023	CAA	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750443
7	NC_016023	TCG	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750443
8	NC_016023	GAT	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750443
9	NC_016023	TCT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
10	NC_016023	CTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
11	NC_016023	TTC	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
12	NC_016023	T	7	7	1909	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	347750443
13	NC_016023	CGG	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750443
14	NC_016023	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750443
15	NC_016023	ACA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750443
16	NC_016023	CCA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750444
17	NC_016023	TTG	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750444
18	NC_016023	GTC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750444
19	NC_016023	CAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750444
20	NC_016023	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750444
21	NC_016023	AGTG	2	8	2446	2453	25 %	25 %	50 %	0 %	347750444
22	NC_016023	CGGCT	2	10	2530	2539	0 %	20 %	40 %	40 %	347750444
23	NC_016023	CAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750444
24	NC_016023	AATC	2	8	2550	2557	50 %	25 %	0 %	25 %	347750444
25	NC_016023	T	6	6	2583	2588	0 %	100 %	0 %	0 %	347750444
26	NC_016023	CGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750444
27	NC_016023	TG	3	6	2635	2640	0 %	50 %	50 %	0 %	347750444
28	NC_016023	AAGCCG	2	12	2729	2740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750444
29	NC_016023	CTTT	2	8	2775	2782	0 %	75 %	0 %	25 %	347750445
30	NC_016023	TCT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
31	NC_016023	GCCG	2	8	2804	2811	0 %	0 %	50 %	50 %	347750445
32	NC_016023	CCCG	2	8	2919	2926	0 %	0 %	25 %	75 %	347750445
33	NC_016023	CAT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750445
34	NC_016023	GGC	3	9	3308	3316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
35	NC_016023	T	6	6	3321	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	347750445
36	NC_016023	GGC	2	6	3379	3384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
37	NC_016023	CAGC	2	8	3389	3396	25 %	0 %	25 %	50 %	347750445
38	NC_016023	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
39	NC_016023	A	6	6	3428	3433	100 %	0 %	0 %	0 %	347750445
40	NC_016023	TTTC	2	8	3518	3525	0 %	75 %	0 %	25 %	347750445
41	NC_016023	GC	3	6	3618	3623	0 %	0 %	50 %	50 %	347750445
42	NC_016023	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750445
43	NC_016023	CAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750445
44	NC_016023	CTT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
45	NC_016023	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
46	NC_016023	T	6	6	3723	3728	0 %	100 %	0 %	0 %	347750445
47	NC_016023	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	347750445
48	NC_016023	ATC	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750446
49	NC_016023	T	6	6	3878	3883	0 %	100 %	0 %	0 %	347750446
50	NC_016023	GAT	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750446
51	NC_016023	CGCT	2	8	3925	3932	0 %	25 %	25 %	50 %	347750446
52	NC_016023	TCA	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750446
53	NC_016023	T	6	6	3980	3985	0 %	100 %	0 %	0 %	347750446
54	NC_016023	TCCG	2	8	4118	4125	0 %	25 %	25 %	50 %	347750447
55	NC_016023	TCA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750447
56	NC_016023	CTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
57	NC_016023	TAA	2	6	4244	4249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750447
58	NC_016023	GTTC	2	8	4252	4259	0 %	50 %	25 %	25 %	347750447
59	NC_016023	TTCCG	2	10	4261	4270	0 %	40 %	20 %	40 %	347750447
60	NC_016023	CTT	2	6	4342	4347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
61	NC_016023	CCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
62	NC_016023	TGC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750447
63	NC_016023	AT	3	6	4552	4557	50 %	50 %	0 %	0 %	347750447
64	NC_016023	TTC	2	6	4599	4604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
65	NC_016023	CTGTT	2	10	4631	4640	0 %	60 %	20 %	20 %	347750447
66	NC_016023	T	6	6	4643	4648	0 %	100 %	0 %	0 %	347750447
67	NC_016023	GC	3	6	4649	4654	0 %	0 %	50 %	50 %	347750447
68	NC_016023	CGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
69	NC_016023	CTTC	2	8	4696	4703	0 %	50 %	0 %	50 %	347750447
70	NC_016023	AAC	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750447
71	NC_016023	GCA	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750447
72	NC_016023	GAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750447
73	NC_016023	CATAT	2	10	4799	4808	40 %	40 %	0 %	20 %	347750447
74	NC_016023	TCG	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750447
75	NC_016023	TTC	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
76	NC_016023	TTC	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
77	NC_016023	T	6	6	4972	4977	0 %	100 %	0 %	0 %	347750447
78	NC_016023	TCT	2	6	4992	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
79	NC_016023	AGTGG	2	10	5003	5012	20 %	20 %	60 %	0 %	347750447
80	NC_016023	GCC	2	6	5114	5119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
81	NC_016023	T	6	6	5158	5163	0 %	100 %	0 %	0 %	347750447
82	NC_016023	T	7	7	5211	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	347750447
83	NC_016023	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
84	NC_016023	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750447
85	NC_016023	TTTTC	2	10	5476	5485	0 %	80 %	0 %	20 %	347750448
86	NC_016023	CACTT	2	10	5709	5718	20 %	40 %	0 %	40 %	347750448
87	NC_016023	TTC	2	6	5720	5725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750448
88	NC_016023	GGGT	2	8	5802	5809	0 %	25 %	75 %	0 %	347750448
89	NC_016023	CGC	2	6	5836	5841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750448
90	NC_016023	GAT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750448
91	NC_016023	T	6	6	5919	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	347750448
92	NC_016023	ATTC	2	8	5950	5957	25 %	50 %	0 %	25 %	347750448
93	NC_016023	A	6	6	5976	5981	100 %	0 %	0 %	0 %	347750448
94	NC_016023	TCG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750448
95	NC_016023	AAG	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750448
96	NC_016023	T	6	6	6122	6127	0 %	100 %	0 %	0 %	347750448
97	NC_016023	CGG	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750448
98	NC_016023	T	6	6	6226	6231	0 %	100 %	0 %	0 %	347750448
99	NC_016023	GGC	2	6	6260	6265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750448
100	NC_016023	GCAA	2	8	6303	6310	50 %	0 %	25 %	25 %	347750448
101	NC_016023	CAAGC	2	10	6329	6338	40 %	0 %	20 %	40 %	347750448
102	NC_016023	CTT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750448
103	NC_016023	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	347750448
104	NC_016023	AAAGGG	2	12	6397	6408	50 %	0 %	50 %	0 %	347750448
105	NC_016023	GC	3	6	6420	6425	0 %	0 %	50 %	50 %	347750448
106	NC_016023	A	7	7	6435	6441	100 %	0 %	0 %	0 %	347750448
107	NC_016023	TCA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750448
108	NC_016023	ATTT	2	8	6468	6475	25 %	75 %	0 %	0 %	347750449
109	NC_016023	T	8	8	6478	6485	0 %	100 %	0 %	0 %	347750449
110	NC_016023	GCT	2	6	6486	6491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
111	NC_016023	ACA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750449
112	NC_016023	TTC	2	6	6604	6609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
113	NC_016023	TTTAC	2	10	6686	6695	20 %	60 %	0 %	20 %	347750449
114	NC_016023	CGACTT	2	12	6711	6722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347750449
115	NC_016023	TCAA	2	8	6737	6744	50 %	25 %	0 %	25 %	347750449
116	NC_016023	TTC	2	6	6746	6751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
117	NC_016023	TGT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750449
118	NC_016023	CGTC	2	8	6771	6778	0 %	25 %	25 %	50 %	347750449
119	NC_016023	GAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750449
120	NC_016023	TCG	2	6	6954	6959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
121	NC_016023	CAT	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750449
122	NC_016023	CTG	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
123	NC_016023	CTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
124	NC_016023	CATC	2	8	7218	7225	25 %	25 %	0 %	50 %	347750449
125	NC_016023	TTCGA	2	10	7271	7280	20 %	40 %	20 %	20 %	347750449
126	NC_016023	CGG	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750449
127	NC_016023	TGAA	2	8	7419	7426	50 %	25 %	25 %	0 %	347750449
128	NC_016023	AAC	2	6	7547	7552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750449
129	NC_016023	CGTG	2	8	7560	7567	0 %	25 %	50 %	25 %	347750449
130	NC_016023	GGA	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347750449
131	NC_016023	CTT	3	9	7662	7670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
132	NC_016023	TTC	2	6	7711	7716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
133	NC_016023	CTT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
134	NC_016023	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
135	NC_016023	CG	3	6	7779	7784	0 %	0 %	50 %	50 %	347750449
136	NC_016023	TCT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
137	NC_016023	T	7	7	7818	7824	0 %	100 %	0 %	0 %	347750449
138	NC_016023	CCA	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750449
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142	NC_016023	CTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
143	NC_016023	T	6	6	8061	8066	0 %	100 %	0 %	0 %	347750449
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159	NC_016023	TGA	2	6	9041	9046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750450
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260	NC_016023	GTT	2	6	13899	13904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750455
261	NC_016023	GTT	2	6	13935	13940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750455
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263	NC_016023	TTG	2	6	13972	13977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750455
264	NC_016023	TGC	2	6	14009	14014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750455
265	NC_016023	GTTATT	2	12	14025	14036	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347750455
266	NC_016023	CTG	2	6	14041	14046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750455
267	NC_016023	GTTT	2	8	14129	14136	0 %	75 %	25 %	0 %	347750455
268	NC_016023	CTT	2	6	14167	14172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750455
269	NC_016023	CTG	2	6	14214	14219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750455
270	NC_016023	ATG	2	6	14340	14345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750455
271	NC_016023	T	7	7	14552	14558	0 %	100 %	0 %	0 %	347750456
272	NC_016023	GCCTG	2	10	14601	14610	0 %	20 %	40 %	40 %	347750456
273	NC_016023	TTTC	2	8	14617	14624	0 %	75 %	0 %	25 %	347750456
274	NC_016023	CTC	2	6	14633	14638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750456
275	NC_016023	T	7	7	14723	14729	0 %	100 %	0 %	0 %	347750457
276	NC_016023	GAT	2	6	14746	14751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750457
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278	NC_016023	GA	3	6	14795	14800	50 %	0 %	50 %	0 %	347750457
279	NC_016023	T	8	8	14804	14811	0 %	100 %	0 %	0 %	347750457
280	NC_016023	CCTT	2	8	14897	14904	0 %	50 %	0 %	50 %	347750457
281	NC_016023	T	6	6	14929	14934	0 %	100 %	0 %	0 %	347750457
282	NC_016023	CTT	2	6	15051	15056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750458
283	NC_016023	CGGC	2	8	15089	15096	0 %	0 %	50 %	50 %	347750458
284	NC_016023	ATC	2	6	15097	15102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750458
285	NC_016023	TCA	2	6	15104	15109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750458
286	NC_016023	TCA	2	6	15137	15142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750458
287	NC_016023	CAA	2	6	15315	15320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750458
288	NC_016023	GTC	2	6	15373	15378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750458
289	NC_016023	CGGT	2	8	15485	15492	0 %	25 %	50 %	25 %	347750458
290	NC_016023	TGT	2	6	15640	15645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750458
291	NC_016023	CGG	2	6	15718	15723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750458
292	NC_016023	CAG	2	6	15724	15729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750458
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294	NC_016023	CTGT	2	8	15879	15886	0 %	50 %	25 %	25 %	347750458
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298	NC_016023	CTT	2	6	16005	16010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750458
299	NC_016023	CG	3	6	16025	16030	0 %	0 %	50 %	50 %	347750458
300	NC_016023	AC	3	6	16032	16037	50 %	0 %	0 %	50 %	347750458
301	NC_016023	GCG	2	6	16096	16101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750458
302	NC_016023	CTTTTT	2	12	16158	16169	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347750458
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380	NC_016023	CATC	2	8	20131	20138	25 %	25 %	0 %	50 %	347750460
381	NC_016023	ATGGAG	2	12	20153	20164	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347750460
382	NC_016023	CG	3	6	20206	20211	0 %	0 %	50 %	50 %	347750460
383	NC_016023	TGC	2	6	20275	20280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750460
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385	NC_016023	TTC	2	6	20304	20309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750460
386	NC_016023	CCGC	2	8	20405	20412	0 %	0 %	25 %	75 %	347750460
387	NC_016023	TTTCG	2	10	20423	20432	0 %	60 %	20 %	20 %	347750460
388	NC_016023	CCG	2	6	20462	20467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750460
389	NC_016023	TTC	2	6	20468	20473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750460
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391	NC_016023	GGC	2	6	20491	20496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750460
392	NC_016023	ATC	3	9	20501	20509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750460
393	NC_016023	CGT	2	6	20545	20550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750460
394	NC_016023	TTC	2	6	20555	20560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750460
395	NC_016023	TCT	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750460
396	NC_016023	T	6	6	20630	20635	0 %	100 %	0 %	0 %	347750460
397	NC_016023	TTC	2	6	20639	20644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750460
398	NC_016023	GCC	2	6	20679	20684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750460
399	NC_016023	GCT	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750460
400	NC_016023	ACC	2	6	20799	20804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750460
401	NC_016023	AAG	2	6	20923	20928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750460
402	NC_016023	T	6	6	21025	21030	0 %	100 %	0 %	0 %	347750460
403	NC_016023	A	6	6	21036	21041	100 %	0 %	0 %	0 %	347750460
404	NC_016023	TCA	2	6	21120	21125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750460
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412	NC_016023	CAGG	2	8	21520	21527	25 %	0 %	50 %	25 %	347750461
413	NC_016023	CATC	2	8	21577	21584	25 %	25 %	0 %	50 %	347750461
414	NC_016023	TTG	2	6	21638	21643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750461
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499	NC_016023	CAC	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750464
500	NC_016023	AGC	2	6	26445	26450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750464

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